STR-генотипирование осетровых рыб, выращиваемых в УЗВ: значение и перспектива применения
УДК: 639.371/.374; 577.21 DOI: 10.31588/2413_4201_1883_2_255_116
Ключевые слова:
рыбы, осетр, генотипирование, STR, УЗВАннотация
Генетическая идентификации осетровых рыб в условиях индустраильной аквакультуры обусловлена необходимостью при формировании пар для воспроизводства, т.к. при разведении осетровых на установках замкнутого водоснабжения (УЗВ) имеется риск близкородственого скрещивания и как следствие -- инбридинг, приводящий к снижению продуктивности и плодовитости рыб. Для изучения генетической структуры осетровых рыб в качестве генетического маркера является микросателлиты, ввиду широкой распространенности их по всему геному, и служат инструментом для высокоэффективного генетического картирования и характеристики таксонов, установления филогенетических связей, уточнения конспецифических гибридизаций, идентификации посадочного материала.
В статье приведены результаты исследований по оценке полиморфизма по 7 микросателлитным локусам ДНК осетровых рыб, в которых идентифицировано 69 аллелей. Все исследуемые особи были гетерозиготными, соответственно, уровень наблюдаемой гетерозиготности равнялся 1. На основании полученных результатов оценки полиморфизма STR-локусов у сибирских осетров, выращиваемых в УЗВ, установлено, что в исследуемой группе соотношение ожидаемой и наблюдаемой гетерозиготности, а также показателя индекса фиксации (Fis), говорит об избытке гетерозигот в них и высоком «запасе» генетического разнообразия по STR-локусам.
Литература
Барминцева, А. Е. Использование микросателлитных локусов для установления видовой принадлежности осетровых (Acipenseridae) и выявления особей гибридного происхождения / А. Е. Барминцева, Н. С. Мюге // Генетика. -- 2013. -- Т. 49. -- № 9. -- С. 1093-1105.
Козлова, Н. Применение молекулярно-генетических исследований в аквакультуре осетровых рыб / Н. Козлова, Н. Базелюк, Д. Файзулина, Е. Стоногина // Вестник Астраханского государственного технического университета. Серия: Рыбное хозяйство. -- 2013. -- №. 3. -- С. 113-117.
Мюге, Н.С. Полиморфизм контрольного региона митохондриальной ДНК восьми видов осетровых и разработка системы ДНК-идентификации видов / Н. С. Мюге, А. Е. Барминцева, С. М. Расторгуев [и др.] // Генетика. 2008. -- Т. 44. -- С. 1-7.
Чебанов, М. С. Формирование генетической коллекции осетровых в южном филиале ФГУП ФСГЦР / М. С. Чебанов // Материалы Первой Всероссийской конференции «Генетика, селекция и воспроизводство рыб», СПб, 2002. -- С. 73-80.
Шалгимбаева, Г.М. Генетическое разнообразие севрюги реки Урал / Г. М. Шалгимбаева, А. Е. Барминцева, Л. Н. Мюге, К. Б. Исбеков, Н. С. Мюге // Труды ВНИРО, 2018. -- Т. 171. -- С. 95-105.
Barmintseva, A. E. Natural genetic polymorphism and phylogeography of Siberian sturgeon Acipenser baerii Brandt, 1869 / A. E. Barmintseva, N. S. Myuge, // Russian Journal of Genetics, 2017. -- V. 53(3). -- Р. 358-368. DOI: 10.1134/S1022795417030024
Georgescu, S. E. Analysis of the microsatellite variation in the common hybrid between russian sturgeon (Acipenser Gueldenstaedtii) and siberian sturgeon (Acipenser Baerii) from aquaculture / S. E. Georgescu, O. Canareica, A. Dudu, M. Costache // Transylvanian Review of Systematical and Ecological Research. -- 2013. -- V. 15.2. -- Р. 117-124.
Henderson-Arzapalo, A. Novel microsatellite markers for Atlantic sturgeon (Acipenser oxyrinchus) population delineation and broodstock management / A. Henderson-Arzapalo, T. L. King // Molecular Ecology Notes. -- 2002. -- V. 2. -- P. 437-439.
Nazari, S. Analysis of the genetic structure of the Persian sturgeon (Acipenser persicus) populations: Comparison of control region sequencing and PCR-RFLP analysis of mitochondrial DNA / S. Nazari, M. Pourkazemi, M. R. Khoshkholgh // Iranian Journal of Fisheries Sciences. -- 2020. -- V. 19(6). -- Р. 3201-3220.
Nei, M. Accuracy of estimated phylogenetic trees from molecular data. II. Gene frequency data / M. Nei, F. Tajima, Y. Tateno // Journal of Molecular Evolution. -- 1983. -- Vol. 19. -- P. 153-170.
Welsh, A. B. Identification of microsatellite loci in lake sturgeon. Acipencer fulvescens, and their variability in green sturgeon, A. medirostris / A. B. Welsh, M. Blumberg, B. May // Mol. Ecol. Notes, 2003. -- V. 3. -- P. 47-55.
Barmintseva, A. E. Use of microsatellite loci for species identification of sturgeons (Acipenseridae) and detection of hybrid individuals / A. E. Barmintseva, N. S. Myuge // Genetics. -- 2013. -- Vol. 49. -- No. 9. -- P. 1093-1105.
Kozlova, N. Application of molecular genetic research in sturgeon aquaculture / N. Kozlova, N. Bazelyuk, D. Fayzulina, E. Stonogina // Bulletin of the Astrakhan State Technical University. Series: Fisheries. -- 2013. -- No. 3. -- P. 113-117.
Myuge, N.S. Polymorphism of the mitochondrial DNA control region of eight sturgeon species and development of a DNA identification system / N. S. Myuge, A. E. Barmintseva, S. M. Rastorguev [et al.] // Genetics. 2008. -- Vol. 44. -- P. 1-7.
Chebanov, M. S. Formation of a genetic collection of sturgeons in the southern branch of FGUP FSGTsR / M. S. Chebanov // Proceedings of the First All-Russian Conference "Genetics, breeding and reproduction of fish", St. Petersburg, 2002. -- P. 73-80.
Shalgimbayeva, G.M. Genetic diversity of the Ural River sturgeon / G. M. Shalgimbayeva, A. E. Barmintseva, L. N. Myuge, K. B. Isbekov, N. S. Myuge // Proceedings of VNIRO, 2018. -- Vol. 171. -- P. 95-105.
Barmintseva, A. E. Natural genetic polymorphism and phylogeography of Siberian sturgeon Acipenser baerii Brandt, 1869 / A. E. Barmintseva, N. S. Myuge, // Russian Journal of Genetics, 2017. -- V. 53(3). -- P. 358-368. DOI: 10.1134/S1022795417030024
Georgescu, S. E. Analysis of the microsatellite variation in the common hybrid between russian sturgeon (Acipenser Gueldenstaedtii) and siberian sturgeon (Acipenser Baerii) from aquaculture / S. E. Georgescu, O. Canareica, A. Dudu, M. Costache // Transylvanian Review of Systematical and Ecological Research. -- 2013. -- V. 15.2. -- P. 117-124.
Henderson-Arzapalo, A. Novel microsatellite markers for Atlantic sturgeon (Acipenser oxyrinchus) population delineation and broodstock management / A. Henderson-Arzapalo, T. L. King // Molecular Ecology Notes. -- 2002. -- V. 2. -- P. 437-439.
Nazari, S. Analysis of the genetic structure of the Persian sturgeon (Acipenser persicus) populations: Comparison of control region sequencing and PCR-RFLP analysis of mitochondrial DNA / S. Nazari, M. Pourkazemi, M. R. Khoshkholgh // Iranian Journal of Fisheries Sciences. -- 2020. -- V. 19(6). -- P. 3201-3220.
Nei, M. Accuracy of estimated phylogenetic trees from molecular data. II. Gene frequency data / M. Nei, F. Tajima, Y. Tateno // Journal of Molecular Evolution. -- 1983. -- Vol. 19. -- P. 153-170.
Welsh, A. B. Identification of microsatellite loci in lake sturgeon. Acipencer fulvescens, and their variability in green sturgeon, A. medirostris / A. B. Welsh, M. Blumberg, B. May // Mol. Ecol. Notes, 2003. -- V. 3. -- P. 47-55.
