ВЫЯВЛЕНИЕ РОТАВИРУСА СВИНЕЙ МЕТОДОМ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ
УДК: 619:616.98:579.843.95:579.852.13 DOI: 10.31588/2413_4201_1883_2_266_81
Ключевые слова:
Ротавирус, эпизоотические изоляты, SPEV, РК-15, адаптация, ОТ-ПЦРАннотация
Ротавирус -- кишечный патоген, вызывающий гастроэнтерит у детей и молодняка животных. Данный возбудитель является причиной значительного экономического ущерба в животноводстве. В настоящее время не существует специфических лекарственных средств для лечения ротавирусной инфекции, поэтому возможности лечения данной болезни остаются ограниченными. В связи с этим разработка технологии изготовления вакцины против ротавирусной инфекции свиней остается актуальной и востребованной. Также в качестве генетического контроля разрабатываемой вакцины необходимо иметь методику для индикации и идентификации ротавируса свиней, основанную на современных молекулярно-генетических методах, таких как ОТ-ПЦР, ПЦР-ПДРФ, секвенирование и др. В качестве объекта исследований использовали патологический материал (образцы легких, селезенки и кишечника), отобранный от павших и вынужденно убитых поросят до 10-12-дневного возраста из неблагополучных по вирусным заболеваниям хозяйств Республик Башкортостан и Татарстан. Для выделения возбудителя ротавируса использовали перевиваемые линии животных клеток SPEV и РК-15. В результате поиска наиболее специфичных генетических локусов ротавируса свиней установлено, что наиболее специфичными генами являются гены VP4, VP6 и VP7, и их можно использовать для индикации и идентификации изучаемого возбудителя. Для каждого из них разработаны специфичные праймерные комбинации с программами постановки ОТ-ПЦР. Проведённый BLASTn-анализ доказал специфичность разработанных праймеров к геному ротавирусов свиней. На вирусных изолятах, адаптированных к клеткам SPEV и РК-15, доказана работоспособность разработанных праймерных комбинаций и программ постановки ОТ-ПЦР для каждого найденного генетического локуса генома ротавируса свиней. Установлен положительный результат при исследовании 12 образцов антигенного материала (из легких, кишечника, селезенки). Разработан алгоритм индикации и идентификации ротавируса свиней с использованием ОТ-ПЦР и ПЦР-ПДРФ.
Литература
Isolation, Genomic Characterization, and Immunogenicity Evaluation of a G9P[23] Porcine Rotavirus Strain / Z. Wang, W. Huang, G. Yan [et al.] // Veterinary Sciences. 2025. Vol. 12. No. 2. P. 180. https://doi.org/ 10.3390/ vetsci12020180. EDN XRCOGS.
Molecular Characterization and Pathogenicity Analysis of Porcine Rotavirus A / Ya. Lv, Ze. Tong, J. Liu [et al.] // Viruses. 2024. Vol. 16. No. 12. P. 1842. https://doi.org/ 10.3390/v16121842. EDN JNKADO.
Julian T. R. Environmental transmission of diarrheal pathogens in low and middle income countries. Environmental Sciences: Processes and Impacts. 2016. Vol. 18, No. 8. P. 944-55. https://doi.org/ 10.1039/c6em00222f.
Isolation and possibility of vertical transmission of G9P[23] and G12P[7] group A rotavirus strains in pigs / Ya. Li, Ch. Gao, L. Wu [et al.] // Porcine Health Management. 2025. Vol. 11. No. 1. P. 32. https://doi.org/ 10.1186/ s40813-025-00445-6. EDN HJGDOP.
Rotavirus research: 2014--2020 / S. Caddy, G. Papa, A. Borodavka, U. Desselberger // Virus Research. 2021. Vol. 304. P. 198499. https://doi.org/ 10.1016/j.virusres.2021.198499. EDN FTPIDA.
Identification of Putative Novel Rotavirus H VP7, VP4, VP6 and NSP4 Genotypes in Pigs / E. Ferrari, G. Vignola, C. Bertasio [et al.] // Viruses. 2024. Vol. 16, No. 1. P. 68. https://doi.org/ 10.3390/v16010068. EDN CLSXHM.
Isolation, Genomic Characterization and Evolution of Six Porcine Rotavirus A Strains in a Pig Farming Group / Zh. Zhang, Ch. Wu, Yu. Chen [et al.] // Veterinary Sciences. 2024. Vol. 11. No. 9. P. 436. https://doi.org/ 10.3390/vetsci11090436. EDN QBWHYC.
Великжанина Е. И., Сашина Т. А., Новикова Н. А. Реассортантные штаммы Rotavirus A (Sedoreoviridae: Rotavirus: Rotavirus A): роль ротавирусов животных в возникновении новых вариантов ротавируса человека // Вопросы вирусологии. 2025. Т. 70, № 2. С. 105-116. https://doi.org/ 10.36233/0507-4088-306. EDN PFCBAZ.
Sadiq A., Khan Ja. Rotavirus in developing countries: molecular diversity, epidemiological insights, and strategies for effective vaccination // Frontiers in Microbiology. 2024. Vol. 14. https://doi.org/10.3389/ fmicb.2023.1297269. EDN TTLTKD.
Махмутов А. Ф., Спиридонов А. Г., Спиридонов Г. Н. Применение ассоциированной вакцины и гипериммунной сыворотки при смешанной форме инфекционной диареи новорожденных поросят // Ветеринарный врач. 2021. № 1. С. 30-37. https://doi.org/10.33632/1998-698X.2021-1-30-38. EDN QAPWED.
Выделение и изучение эпизоотических изолятов ротавируса свиней / Э. М. Плотникова, М. А. Ефимова, К. Т. Ишмухаметов [и др.] // Инновационные решения актуальных вопросов биологической, токсикологической и радиационной безопасности для АПК: Сборник материалов Международной научно-практической конференции, посвящённой 65-летию ФГБНУ «ФЦТРБ-ВНИВИ», Казань, 11--12 сентября 2025 года. Казань: ФГБНУ «ФЦТРБ-ВНИВИ, 2025. С. 143-144. EDN DYIPVB.
Отбор высокоиммуногенных штаммов ротавирусов свиней, выделенных из органов пораженных вирусами животных / Э. М. Плотникова, И. Р. Мухаметшин, М. М. Шакуров [и др.] // Ученые записки Казанской академии ветеринарной медицины им. Н.Э. Баумана. 2025. Т. 264, № 4. С. 71-76. https:// doi.org/10.31588/2413-4201-1883-4-264-71.
Vlasova A., Amimo J., Saif L. Porcine Rotaviruses: Epidemiology, Immune Responses and Control Strategies // Viruses. 2017. Vol. 9. No. 3. Р. 48. https://doi.org/10.3390/v9030048.
Predominance of Porcine P[23] Genotype Rotaviruses in Piglets with Diarrhea in Northern Thailand / S. Okitsu, P. Khamrin, A. Thongprachum [et al.] // Journal of clinical microbiology. 2011. Vol. 49, No. 1. Р. 442-445. https://doi.org/ 10.1128/jcm.02263-10.
Review of group A rotavirus strains reported in swine and cattle / H. Papp, B. László, F. Jakab [et al.] // Veterinary microbiology. 2013. Vol. 165. No. 3-4. Р. 190-199. https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2013.03.020.
Wang Z, Huang W, Yan G. Isolation, genomic characterization and immunogenicity evaluation of a G9P[23] porcine rotavirus strain. Veterinary Sciences. 2025; Vol.12. No.2. 180 p. https://doi.org/ 10.3390/vetsci12020180. EDN: XRCOGS.
Lv Ya, Tong Ze, Liu J. Molecular characterization and pathogenicity analysis of porcine rotavirus A. Viruses. 2024; Vol.16. No.12. 1842 p. https://doi.org/ 10.3390/v16121842. EDN: JNKADO.
Julian TR. Environmental transmission of diarrheal pathogens in low and middle income countries. Environmental Sciences: Processes and Impacts. 2016; Vol.18. No.8. 944-55 p. https://doi.org/ 10.1039/c6em00222f.
Li Ya, Gao Ch, Wu L. Isolation and possibility of vertical transmission of G9P[23] and G12P[7] group A rotavirus strains in pigs. Porcine Health Management. 2025; Vol.11. No.1. 32 p. https://doi.org/ 10.1186/s40813-025-00445-6. EDN: HJGDOP.
Caddy S, Papa G, Borodavka A, Desselberger U. Rotavirus research: 2014-2020. Virus Research. 2021; Vol.304. 198499 p. https://doi.org/ 10.1016/j.virusres.2021.198499. EDN: FTPIDA.
Ferrari E, Vignola G, Bertasio C. Identification of putative novel rotavirus H VP7, VP4, VP6 and NSP4 genotypes in pigs. Viruses. 2024; Vol.16. No.1. 68 p. https://doi.org/ 10.3390/v16010068. EDN: CLSXHM.
Zhang Zh, Wu Ch, Chen Yu. Isolation, genomic characterization and evolution of six porcine rotavirus A strains in a pig farming group. Veterinary Sciences. 2024; Vol.11. No.9. 436 p. https://doi.org/ 10.3390/vetsci11090436. EDN: QBWHYC.
Velikzhanina EI, Sashina TA, Novikova NA. [Reassortant strains of Rotavirus A (Sedoreoviridae: Rotavirus: Rotavirus A): the role of animal rotaviruses in the emergence of new variants of human rotavirus]. Voprosy virusologii. 2025; Vol.70. 2. 105-116 p. https://doi.org/ 10.36233/0507-4088-306. EDN: PFCBAZ.
Sadiq A, Khan Ja. Rotavirus in developing countries: molecular diversity, epidemiological insights and strategies for effective vaccination. Frontiers in Microbiology. 2024; Vol.14. https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1297269. EDN: TTLTKD.
Makhmutov AF, Spiridonov AG, Spiridonov GN. [Use of an associated vaccine and hyperimmune serum for mixed form of infectious diarrhea in newborn piglets]. Veterinarnyy vrach. 2021; 1. 30-37 p. https://doi.org/10.33632/1998-698X.2021-1-30-38. EDN: QAPWED.
Plotnikova EM, Efimova MA, Ishmukhametov KT. [Isolation and study of epizootic isolates of porcine rotavirus. Innovative solutions to current issues of biological, toxicological and radiation safety for agro-industrial complex]. Sbornik materialov Mezhdunarodnoy nauchno-prakticheskoy konferentsii, posvyashchennoy 65-letiyu FGBNU FTsTRB-VNIVI, Kazan, 11-12 sentyabrya 2025 goda. Kazan: FGBNU FTsTRB-VNIVI. 2025; 143-144 p. EDN: DYIPVB.
Plotnikova EM, Mukhametshin IR, Shakurov MM. [Selection of highly immunogenic strains of porcine rotaviruses isolated from organs of virus-infected animals]. Uchenye zapiski Kazanskoy akademii veterinarnoy meditsiny im. N.E. Baumana. 2025; Vol.264. 4. 71-76 p. https://doi.org/10.31588/2413-4201-1883-4-264-71.
Vlasova A, Amimo J, Saif L. Porcine rotaviruses: epidemiology, immune responses and control strategies. Viruses. 2017; Vol.9. No.3. 48 p. https://doi.org/10.3390/v9030048.
Okitsu S, Khamrin P, Thongprachum A. Predominance of porcine P[23] genotype rotaviruses in piglets with diarrhea in Northern Thailand. Journal of clinical microbiology. 2011; Vol.49. No.1. 442-445 p. https://doi.org/ 10.1128/ jcm.02263-10.
Papp H, Laszlo B, Jakab F. Review of group A rotavirus strains reported in swine and cattle. Veterinary microbiology. 2013; Vol.165. No.3-4. 190-199 p. https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2013.03.020.
