СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АСПЕКТ МИКРОБИОТЫ КИШЕЧНИКА ТЕЛЯТ СИММЕНТАЛЬСКОЙ И ГОЛШТИНО-ФРИЗСКОЙ ПОРОД МЕТОДОМ 16S МЕТАГЕНОМНОГО АНАЛИЗА
УДК: 579.64:631 DOI: 10.31588/2413_4201_1883_4_256_282
Ключевые слова:
телята, симментальская, голштино-фризская породы, микробиота кишечника, метагеномный анализАннотация
В статье приводятся исследовательские результаты в сравнительном аспекте микробиоты кишечника телят симментальской и голштино-фризской пород, в возрасте 2-5 дней, при помощи 16S метагеномного анализа. По результатам исследования сделано заключение, что телята симментальской породы имеют наиболее широкий состав микробного профиля в кишечнике по сравнению с микробиотой кишечника телят голштино-фризской породы. У голштино-фризской породы наибольшая численность условно-патогенных бактерий превалирует над молочнокислыми и облигатными. Согласно анализа, телята голштино-фризской породы наиболее подвержены проникновению патогенной микрофлоры, чем телята симментальской породы.
Литература
Барко, П. С. Желудочно-кишечный микробиом / П. С. Барко, М. А. Мак Майкл, К. С. Суонсон [и др.] // Обзор J.Vet.Intern.Med. -- 2018. -- № 32(1). -- С. 79-84.
Шевелева, С. А. Микробиом кишечника: от эталона нормы к патологии / С. А. Шевелева, И. Б. Куваева, Н. Р. Ефимочкина [и др.] // Вопросы питания. Scopus. -- 2020. -- Т. 89. -- № 4. -- С. 35-51.
lee, D. H. Close genetic relationship between salmonella enterica serovar enteritidis isolated from patients with diarrhoea and poultry in the republic of korea / D.-H. lee, J.-Y. Hyeon. -- Text: direct // Clinical microbiology and infectionseptember. -- 2016. -- Р. 68-70.
Ellis, T. N. Virulence and immunomodulatory role of bacterial outer membrane vesicles / T. N. Ellis, M. J. Kuen -- Text: electronic // Microbiol Mol Biol Rev. -- 2019. -- № 74 (1). -- Р. 81 -- 94. -- Doi: https:// doi.org/10.1128/MMBR.00031-09.
Gueimonde, M. Bile-induced efflux transporter from Bifidobacterium longum N C C - 2705 conferring resistance to bile / М. Gueimonde, Garrigues van Sinderen, de los Reyes-Gavilán. -- Text: direct // Apple Environ Microbiol. -- 2019. -- № 75 (2). -- Р. 315-319.
Haiminen, N. Evaluation of de novo genome assembly methods from high-throughput sequencing reads reveals dependencies that affect the quality of the results / N. Haiminen, D. N. Kun, L. Parida -- Text: direct // PLoS ONE. -- 2014. -- Vol. 6. -- № 9. -- Р. 241 - 248.
Harbby, H. A. Bacterial causes of diarrhea in small animals (kids, lambs and calves) in the Sultanate of Oman / H. A. Harbbie. -- Text: direct // J. Egypt. Vet. Honey. Ass. -- 2012. -- № 62 (3). -- Р. 227 - 235.
Klindworth, А. Evaluation of general 16S ribosomal RNA gene PCR primers for classical and next-generation sequencing-based diversity studies / A. Klindworth, Е. Pruesse, Т. Schweer. -- Text: electronic // Nucleic Acids Res. -- 2013. -- № 41 (1). -- Р. 78-82. DOI: 10.1093/nar/gks808.
Werner, J. J. Bacterial community structures are unique and resilient in full-scale bioenergy systems / J. J. Werner, D. Knights, M. L. Garcia, N. B. Scalfone -- Text: direct // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. -- 2011. -- Vol. 108. --№ 10. -- Р.112-117.
Barko, P. S. Gastrointestinal microbiome / P. S. Barko, M. A. McMichael, K. S. Swanson [et al.] // Review J.Vet.Intern.Med. -- 2018. -- No. 32(1). -- P. 79-84.
Sheveleva, S. A. Intestinal microbiome: from the standard of norm to pathology / S. A. Sheveleva, I. B. Kuvaeva, N. R. Efimochkina [et al.] // Nutrition Issues. Scopus. -- 2020. -- Vol. 89. -- No. 4. -- P. 35-51.
lee, D. H. Close genetic relationship between salmonella enterica serovar enteritidis isolated from patients with diarrhoea and poultry in the republic of korea / D.-H. lee, J.-Y. Hyeon. -- Text: direct // Clinical microbiology and infectionseptember. -- 2016. -- Р. 68-70.
Ellis, T. N. Virulence and immunomodulatory role of bacterial outer membrane vesicles / T. N. Ellis, M. J. Kuen -- Text: electronic // Microbiol Mol Biol Rev. -- 2019. -- No. 74 (1). -- Р. 81-94. -- Doi: https:// doi.org/10.1128/MMBR.00031-09.
Gueimonde, M. Bile-induced efflux transporter from Bifidobacterium longum N C C - 2705 conferring resistance to bile / М. Gueimonde, Garrigues van Sinderen, de los Reyes-Gavilán. -- Text: direct // Apple Environ Microbiol. -- 2019. -- No. 75 (2). -- Р. 315-319.
Haiminen, N. Evaluation of de novo genome assembly methods from high-throughput sequencing reads reveals dependencies that affect the quality of the results / N. Haiminen, D. N. Kun, L. Parida -- Text: direct // PLoS ONE. -- 2014. -- Vol. 6. -- No. 9. -- Р. 241-248.
Harbby, H. A. Bacterial causes of diarrhea in small animals (kids, lambs and calves) in the Sultanate of Oman / H. A. Harbbie. -- Text: direct // J. Egypt. Vet. Honey. Ass. -- 2012. -- No. 62 (3). -- Р. 227-235.
Klindworth, А. Evaluation of general 16S ribosomal RNA gene PCR primers for classical and next-generation sequencing-based diversity studies / A. Klindworth, Е. Pruesse, Т. Schweer. -- Text: electronic // Nucleic Acids Res. -- 2013. -- No. 41 (1). -- Р. 78-82. DOI: 10.1093/nar/gks808.
Werner, J. J. Bacterial community structures are unique and resilient in full-scale bioenergy systems / J. J. Werner, D. Knights, M. L. Garcia, N. B. Scalfone -- Text: direct // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. -- 2011. -- Vol. 108. -- No. 10. -- Р.112-117.
